東亞現代種業研發中心設有玉米生物育種國家重點實驗室、農業部東北主要作物遺傳育種重點實驗室，劃分為

高通量基因芯片基因型分析平臺

高通量熒光PCR-SNP基因型分析平臺

高通量DNA提取平臺

高通量種子質量檢驗平臺

高通量轉基因檢測平臺

高通量DH生產平臺

六大功能平臺，不但可以提供植物基因組服務，在人類及動物基因組方面，可提供肉類和血液的高通量DNA提取、SSR/KASP檢測、芯片檢測和精準醫療服務。

（一）高通量基因芯片基因型分析平臺
引進Affymetrix高通量GeneTitan基因芯片系統及Illumina公司IScan基因芯片系統，并自主研發性價比較高的玉米10KSNP芯片，可應用于不同育種需求，格式靈活多樣。
（二）高通量熒光PCR-SNP基因型分析平臺
KASP基因分型技術是通過利用引物末端堿基的特異匹配來對SNPs和特定位點上的InDels進行精準的雙等位基因判定，具有周期短，驗證率高，成本低，靈活性強等特征，是目前較好的基因分型技術。該技術可廣泛應用于QTL精細定位、種子質量控制、大樣本量的分子標記驗證、分子輔助育種及種子資源鑒定等工作。
（三）高通量DNA提取平臺
該平臺整合了TECAN液體工作站，GenoGrinder2010高通量組織研磨儀，Eppendorf的5810R冷凍離心機等設備，使單日DNA提取量達到10000份，質量得到提高，成本大大降低。
（四）高通量種子質量檢驗平臺
裝備熒光定量PCR設備ABI7900和普通PCR儀20臺，可進行聚丙烯酰胺凝膠電泳和普通瓊脂糖凝膠電泳試驗，自主開發玉米SNP/SSR分子標記400余對，并結合40對部頒標準的SSR核心分子標記，可實現快速、準確、高效的玉米種子純度分析和玉米品種DNA身份鑒定。
（五）高通量轉基因檢測平臺
聯合北京市農林科學院和博奧集團，共同研發了一款擁有自主知識產權的玉米轉基因檢測芯片。芯片基于KASP和熒光定量PCR技術，可同時進行轉基因陰陽性鑒定和轉化事件檢測，具有簡單、快速、靈敏、準確、高效的特點。
（六）高通量DH生產平臺
聯合中科院自動化研究所共同研發了單籽?；铙w切片工作站，并整合了單果穗自動化考種工作站、單倍體自動挑選工作站、單倍體組配加倍系統等設備和技術，可最大限度滿足玉米育種對DH的高通量、高精度、高效率的選擇需求。